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次世代シーケンス GRAS-Di®技術によるゲノム解析

Service > NGS > GRAS-Di
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特徴  サービス内容  ご依頼の流れ  参考価格・お問い合わせ

 

特徴

 

ゲノムワイドなジェノタイピング
コスト良く迅速に、マーカー探索、マーカー選抜、QTL解析、連鎖地図作成等をサポートいたします。

 

pdf 新規GRAS-Di®技術によるゲノム解析 フライヤー(PDF)

イルミナ株式会社ウェビナー「次世代シーケンサーを利用した新規genotyping技術GRAS-Di®の開発」

イルミナiSchool プロフェッショナルウェビナーはこちら

 

GRAS-Di®技術はトヨタ自動車株式会社にて開発されました。

2回のPCR反応によりゲノムを一様にカバーした アンプリコンを増幅後、次世代シーケンサー にてシーケンスを行い、独自に開発された ソフトでジェノタイピング解析を行います。

 

 

  • GBSやRAD-seqに比べて解析領域の偏りが少なく、ゲノム上一様なジェノタイピングが可能。
  • アンプリコン増幅の再現性が非常に高く、ジェノタイプデータの欠損が少ない。
  • ゲノム情報が利用可能な生物種では、アンプリコンマーカーのマッピングとSNP抽出も可能。
  • リファレンス配列が未決定の生物種においても、比較解析を行うサンプルがお手元にあれば、ゲノムワイドなジェノタイピング解析が可能。

 

GRAS-Di®はトヨタ自動車株式会社の登録商標です。
GRAS-Di(グラス ディーアイ) Genotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct

 

サービス内容

 

● 内容:ライブラリ調製からシーケンスデータ解析まで

  1. GRAS-Di®ライブラリ調製
  2. HiSeq2500によるシーケンス
  3. GRAS-Di®解析ソフトによるシーケンスデータの解析(アンプリコンの有無をベースにしたジェノタイピング結果)

 

● オプション:ゲノム情報が利用可能な生物種では、バイオインフォマティクスのご相談を承ります。
(アンプリコンマーカーのマッピングやSNP抽出)
※解析可能な生物種についてはお問い合わせください。

 

● 納品物:シーケンシング配列データ FastQ形式, GRAS-Di®解析ソフトによる解析結果(Excelで閲覧可能な形式)

 

ご依頼の流れ

 

  • gDNA: >30ng/ul, >20ulをお送りください。
    (規定量に満たない場合はご相談ください)
  • 濃度はUVを用いた吸光光度法により測定・ご確認ください。
    (蛍光測定法による定量はご遠慮ください)
  • 冷蔵便もしくは冷凍便にてサンプルをご送付ください。
  • TEへ溶出したgDNAサンプルをご準備ください。

 

※ サンプルが規定量に達しない場合はご相談ください。

※ 電気泳動法などを利用し、RNAのコンタミネーションがないこと、gDNAが分解していないことをご確認ください。

 

参考価格

 

ご計画の対象生物、サンプル数をお知らせください。 最適なプランをご提案いたします。

 

お問い合わせ

 

ライブラリー調製から、HiSeq2500シーケンスとGRAS-Di®データ解析まで

例1)イネ,96サンプル,1レーンの場合 ¥650,000(税別)
1サンプル 約6,800円
例2)イネ,96サンプル,2レーンの場合 ¥1,250,000(税別)
1サンプル 約6,500円
オプション(バイオインフォマティクス) ご相談

お見積もり・資料請求

下記ボタンのリンク先ページに必要事項をご記入の上お申し込みください。

 

お見積り・資料請求

 


お問い合わせ

サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。

 

ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-5492-7214

 

 

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HiSeq, MiSeqはIllumina社の、PacBio SequelはPacific Bioscience社の商標です。

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