次世代シーケンス　16S メタゲノム解析

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特徴

細菌16S-rRNA アンプリコン解析
【細菌16S-rRNA × MiSeq】

メタゲノム解析として、細菌叢内の16S-rRNAの系統的シーケンスを行います。ゲノムDNAをサンプルとしてお預かりし、プライマー合成、アダプターPCR、ライブラリプーリング、MiSeqシーケンシングまでのフルサポート解析を、好評のバリュープライスにて提供します。ランダム配列を含む当社独自のアダプターにより、クラスターパターンを最初に確定しアプリコンシーケンシングで見られる、Q値低下に対する改善を行っています。

細菌16S-rRNA V1-V3,V3-V4,V3-V5各領域に対応

サンプル条件

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

精製された微生物ゲノムDNAを1μg 以上、濃度は10 ng/μl 以上にてご調製ください。
サンプルの品質は、解析結果に重大な影響を及ぼしますのでご注意ください。
※DNA量が多い場合でも、微生物由来のDNAの割合が少ない（宿主由来のDNAの割合が多い）場合は、PCRが上手く行かないことがあります。予めご了承ください。
※PCR不成功となり、やむを得ずプロジェクトを中止させて頂く場合にはPCR実施費用（1サンプルあたり¥9,900円（税込））のみを頂戴いたします。
DNAサンプルはRNAのコンタミネーションが無いことをご確認ください。
DNAサンプルは、TEに溶解させた状態で冷蔵もしくは冷凍便にてお送りください。

サービス内容

受領したDNAサンプルについて、品質確認（サンプルQC）を行います。
ご指定の領域をPCRにて増幅します。（弊社オリジナルのプライマーを用います）
その後、アダプターを付加し、ライブラリーを調製します。
調製したライブラリーをMiSeqを用いて、ペアエンド法でシーケンシングします。
取得した配列を用いて、細菌叢のプロファイリングを行います。

納品物

16S rRNA アンプリコンシーケンシング後のバイオインフォマティックス解析

Rawデータ（FASTQ形式）
リードの OTU (クラスタリング) 解析
各 OTUについての種分類解析 (BLAST)
可視化データを含めた解析結果レポート
を納品。

価格・納期

16S rRNA メタゲノム解析

サンプルQC、PCR、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
MiSeq　 2×300bp, 平均16～18万リード/sample
納期： 7～9週

項目	参考価格
6サンプルメタゲノムバリュープライス	￥180,000 /6サンプル＜種分類プロファイル　＋￥60,000＞
8サンプルメタゲノムバリュープライス	￥240,000 /8サンプル＜種分類プロファイル　＋￥80,000＞
12サンプルメタゲノムバリュープライス	￥360,000 /12サンプル＜種分類プロファイル　＋￥120,000＞