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特徴
細菌16S-rRNA アンプリコン解析
【細菌16S-rRNA × MiSeq】
メタゲノム解析として、細菌叢内の16S-rRNAの系統的シーケンスを行います。ゲノムDNAをサンプルとしてお預かりし、プライマー合成、 アダプターPCR、ライブラリプーリング、MiSeqシーケンシングまでのフルサポート解析を、好評のバリュープライスにて提供します。ランダム配列を含む当社独自のアダプターにより、クラスターパターンを最初に確定しアプリコンシーケンシングで見られる、Q値低下に対する改善を行っています。
サンプル条件
DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。
- 精製された微生物ゲノムDNAを1μg 以上、濃度は10 ng/μl 以上にてご調製ください。
- サンプルの品質は、解析結果に重大な影響を及ぼしますのでご注意ください。
※DNA量が多い場合でも、微生物由来のDNAの割合が少ない（宿主由来のDNAの割合が多い）場合は、PCRが上手く行かないことがあります。予めご了承ください。
※PCR不成功となり、やむを得ずプロジェクトを中止させて頂く場合にはPCR実施費用（1サンプルあたり¥9,900円（税込））のみを頂戴いたします。
- DNAサンプルはRNAのコンタミネーションが無いことをご確認ください。
- DNAサンプルは、TEに溶解させた状態で冷蔵もしくは冷凍便にてお送りください。
サービス内容
- 受領したDNAサンプルについて、品質確認（サンプルQC）を行います。
- ご指定の領域をPCRにて増幅します。（弊社オリジナルのプライマーを用います）
- その後、アダプターを付加し、ライブラリーを調製します。
- 調製したライブラリーをMiSeqを用いて、ペアエンド法でシーケンシングします。
- 取得した配列を用いて、細菌叢のプロファイリングを行います。
納品物
16S rRNA アンプリコン シーケンシング後のバイオインフォマティックス解析
- Rawデータ（FASTQ形式）
- リードの OTU (クラスタリング) 解析
- 各 OTUについての種分類解析 (BLAST)
- 可視化データを含めた解析結果レポート
を納品。
価格・納期
16S rRNA メタゲノム解析
- サンプルQC、PCR、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
- MiSeq 2×300bp, 平均16～18万リード/sample
- 納期 ： 7～9週
| 項目 |
参考価格 |
| 6サンプル メタゲノム バリュ ープライス |
￥180,000 /6サンプル
＜種分類プロファイル ＋￥60,000＞ |
| 8サンプル メタゲノム バリュープライス |
￥240,000 /8サンプル
＜種分類プロファイル ＋￥80,000＞ |
| 12サンプル メタゲノム バリュープライス |
￥360,000 /12サンプル
＜種分類プロファイル ＋￥120,000＞ |
お問い合わせ
サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。
ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-6631-0106
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