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マルチオミックス解析

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サービス概要  解析メニュー  納品物  ご注文について

 

サービス概要

 

ひとつのサンプルからRNAとタンパク質を抽出し、トランスクリプトーム解析及びプロテオーム解析を同時に実施します。プロテオーム解析の分析深度が従来よりも圧倒的に高まったことで観測対象となる分子が大幅に増加し、トランスクリプトーム解析データとの遺伝子数の差が小さくなりました。より包括的なデータが得られ、従来の技術では見いだせなかった新しい発見が期待できます。サンプル(細胞、組織の場合)はフェノールグアニジン系の試薬、もしくはRNA保護試薬に浸した状態で送付するだけで良く、RNA・タンパク質抽出から解析までかずさDNA研究所にて一貫して行います。

 

マルチオミックス受託解析の強み

  • 国内で受託解析を実施しているため、海外での解析サービスと比較して安心かつ納期が早い。
  • かずさDIA アップグレード・プラチナと組み合わせることで、従来より対象となるターゲット分子の数が大幅に増加。
  • 専門の研究者によるコンサルティングとアフターフォロー。

 

免責事項

 

 

 

 

トランスクリプトーム解析、プロテオーム解析、メタボローム解析メニューからご希望の項目を選択し、組み合わせることができます。ゲノム解析をご希望の場合はお問合せください。

取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。

 

オプション

 

取得データ 納期 価格
ω-3とω-6系脂肪酸(C18,20,22)由来の酸化代謝物の一斉分析
(100~200分子程度を検出想定)
4~8週間 お問い合わせください
  • ※価格:1サンプルあたり
  • 作業内容:RNA/タンパク質/代謝物抽出* + ご希望の解析メニュー**
  • * サンプルが凍結培養細胞、凍結組織の場合。その他のサンプルはご相談ください。
  • ** ヒト、マウス由来サンプルの場合。
  • 目安納期:ご希望の解析メニューのうち最も納期が長いもの+1週間程度
  • 必要サンプル量(目安)細胞1×107以上、組織50 mg以上、血清/血漿 1 µL以上、尿200 µL以上
  • メニュー、サンプル種により必要サンプル量は増減します。お問合せの上ご確認ください。

 

参考注文例

 

実験目的 ヒト培養細胞を化合物で処理した場合の
トランスクリプトーム・プロテオームへの影響を検討
サンプル数 2(化合物処理・未処理)
選択メニュー トランスクリプトーム解析:3'RNA-Seq
プロテオーム解析:DIAプロテオーム解析
作業内容 RNA・タンパク質抽出、クオリティチェック、
次世代シーケンス(ライブラリ調製+ラン)、
LC-MS/MS(プロテアーゼ処理+質量分析)
サンプル送付 PBSで洗浄した細胞にフェノールグアニジン系試薬を加え
チューブに入れ、液体窒素で凍結、冷凍便送付
参考価格 お問い合わせください
参考納期 9週間

 

納品物

 

以下の成果物を納品いたします。

  • 作業報告書
  • fastqファイル
  • MSデータ
  • MS解析データ
  • 最終的な解析結果を記載したファイルの入ったDVD(またはUSB メモリスティック)

 

ご注文について

 

こちらへお問い合わせください。

ご注文はこちらへ

 

ご注文の流れ

 

  1. お問い合わせフォームに必要事項を記入し送信
  2. お打ち合わせ、お見積り兼発注書・解析依頼書の受け取り
  3. 販売店に発注、解析依頼書にサンプル情報を記入しEmailにて送付
  4. サンプル送付(印刷した解析依頼書を同梱)

 

サンプル送付方法

 

  • 必要サンプル量は各メニューの記載をご参照ください。
  • 細胞、組織にフェノールグアニジン系の試薬*、もしくはRNA保護試薬**を加えた状態でお送りください。
    • ホモジナイズは不要です。
    • 細胞、組織以外のサンプルはお問合せください。
    • *ISOGEN(ニッポンジーン社)、TRIzol(ThermoFisher社)、QIAzol(QIAGEN社)など
    • **RNAlater(ThermoFisher社)など
  • サンプル送付前にサンプル情報を記載した解析依頼書(Excelファイル)をメールにてお送りください。
    サンプル送付時にはプリントアウトした解析書を同梱してください。

 

サンプル 調製方法 送付方法
培養細胞 培地を除去後、PBSにて2回洗浄し、フェノールグアニジン系などの
試薬を加えチューブに入れて液体窒素で凍結
ドライアイスを同梱し冷凍便
組織 取り出した組織をPBSにて血液を除去し、フェノールグアニジン系などの
試薬が入ったチューブに入れて液体窒素で凍結
ドライアイスを同梱し冷凍便

抽出したRNAとタンパク質をお送りいただくことも可能ですが、データのバラつきを最低限にするため、抽出作業は弊社にお任せいただくことをお勧めいたします。

 

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