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サービス概要
多種類の次世代シーケンサーからご提供サンプルに最適な解析メニューを使用し、高水準なシーケンス結果をご提供するサービス
サービス概要
次世代シーケンサー(NGS)を使用した変異解析や遺伝子発現解析などの各種受託解析を承っております。
解析用途に合わせたライブラリー調製の工程のみの受託や、ご自身で調製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。
本受託サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。
NGS受託解析の強み
- 国内で受託解析を実施しているため、海外での解析サービスと比較して安心かつ納期が早い。
- 専門の研究者によるコンサルティングとアフターフォロー。
使用機器
- NextSeq 500, NextSeq 2000, MiSeq (illumina社)
- DNBSEQ-G400RS、DNBSEQ-T1+ (MGI社)
- AVITI24 (Element Biosciences社)
免責事項
サンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。
取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。
ゲノム解析
| 解析メニュー |
取得データ目安 |
必要サンプル量 |
納 期 |
| 全ゲノムシークエンス |
ご依頼内容ごとに設定 |
DNA：2 μg以上
（100 ng/μL以上） |
4週間〜 |
Human Exome-Seq
(150bp Paired-End)
アジレントV6 or V7 |
4,000万リード、6Gb |
DNA：2 μg以上
（100 ng/μL以上） |
8週間 |
- 作業内容：ライブラリ調製＋シーケンサーラン
- 品質確認はオプションとなります。
発現解析
| 解析メニュー |
取得データ目安 |
必要サンプル量 |
納 期 |
真核生物 mRNA-Seq
（TypeA； 75 bp Single-Read） |
1,500万リード、1125Mb |
total RNA：2 μg以上
（40 ng/μL以上） |
4週間 |
真核生物 mRNA-Seq
（TypeB； 75 bp Paired-End） |
3,000万リード、2.25Gb |
total RNA：2 μg以上
（40 ng/μL以上） |
8週間 |
miRNA-Seq
(75bp Single-Read) |
1,500万リード、1125Mb |
total RNA：4 μg以上
（200 ng/μL以上） |
8週間 |
| 3'RNA-Seq |
100万リード |
total RNA：2 μg以上
（40 ng/μL以上） |
8週間 |
| シングルセル3'RNA Seq |
100万リード |
シングルセル |
8週間 |
- 作業内容：クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーラン
- RNA品質検査費用を価格に含みます。弊社推奨基準を満たさない場合、解析中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。品質検査は2回目までは無償で、3回目以降は有償となります。
エピジェネティクス関連
| 解析メニュー |
取得データ目安 |
必要サンプル量 |
納 期 |
Human Bisulfite-Seq
（75 bp Paired-End） |
3,000万リード、2.25Gb |
DNA：4 μg以上
（100 ng/μL以上） |
8週間〜 |
MBD-Seq
(75bp Paired-End) |
3,000万リード、2.25Gb |
DNA：4 μg以上
（100 ng/μL以上） |
8週間〜 |
ChIP-Seq
（75 bp Single-Read） |
ご依頼内容ごとに設定 |
クロマチン免疫沈降後DNA：
100 ng以上（10 ng/μL以上） |
お問い合わせ |
ライブラリ調製
| 解析メニュー |
必要サンプル量 |
納 期 |
| mRNA-Seq用 |
total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上） |
3週間 |
| Total RNA-Seq用 |
total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上） |
3週間 |
| Human Exome-Seq用 |
DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上） |
3週間 |
| 全ゲノム、Target-Seq用 |
DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上） |
3週間 |
※ 納品物は作製済みのライブラリーとなります。
- 作業内容：材料RNAのクオリティチェック、ライブラリ調製、調製したライブラリのクオリティーチェック（長さ、濃度）
- RNA品質検査の結果、推奨基準を満たさない場合、作業中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。
- qPCRによるライブラリの定量はオプション（有料）です。
シーケンサーラン（レーン貸切）
| 解析メニュー |
取得データ目安 |
納 期 |
| NextSeq |
75 bp Single-Read：4億リード、最大30Gb |
4週間 |
| 75bp Paired-End Mid：2.6億リード、最大 19.5Gb |
| 150bp Paired-End Mid：2.6億リード、最大39 Gb |
| 75 bp Paired-End：8億リード、最大60 Gb |
| 150 bp Paired-End：8億リード、最大120 Gb |
| MiSeq |
150 bp Paired-End：2,700万リード、4 Gb |
4週間 |
| 250 bp Paired-End：2,700万リード、6.7 Gb |
| 300 bp Paired-End：4,700万リード、14.1 Gb |
| 150 bp Paired-End Nano：200万リード、300 Mb |
| 250 bp Paired-End Nano：200万リード、500 Mb |
| DNBSEQ-G400RS |
50 bp Single-Read：16億リード、80 Gb |
８週間 |
| 100 bp Single-Read：16億リード、160 Gb |
| 400 bp Single-Read：16億リード、640 Gb |
| 100 bp Paired-End：32億リード、320 Gb |
| 150 bp Paired-End：32億リード、480 Gb |
| 200 bp Paired-End：32億リード、640 Gb |
イルミナライブラリConversion費用
（Conversionを実施、ランは含みません） |
３週間 |
- 作業内容：シーケンサーラン
- 品質確認はオプションとなります。
- Illumina社NextSeq 500、NextSeq 2000でのランも承ります。ご希望の方はお問い合わせください。
ライブラリのクオリティチェック
| 解析メニュー |
納 期 |
| クオリティチェック（バイオアナライザー） |
1週間 |
| 濃度測定（定量PCR） |
1週間 |
抗体可変領域解析
| 解析メニュー |
納 期 |
| 基本解析 |
3～4週間 |
| CDR同定 |
1～2週間 |
- 5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。
納品物
HDDまたはDVD-Rに収納して納品
ご注文について
こちらへお問い合わせください
お見積・お問い合わせは
こちらから
ご注文の流れ
- お問い合わせメールに必要事項を記入し送信
- お打ち合わせ、お見積り兼発注書・解析依頼書の受け取り
- ユーロフィンジェノミクス株式会社からご案内の送付方法に従い、サンプルを送付
サンプル送付方法
- 必要サンプル量は各メニューの記載をご参照ください。
- サンプルが必要量以下の場合、予めご相談いただけますようお願い申し上げます。
- サンプル送付前にサンプル情報を記載した解析依頼書（Excelファイル）をメールにてお送りください。
| サンプル |
送付方法 |
注意事項 |
| ゲノムDNA |
チューブに入れ、冷蔵便 |
保冷剤を同梱される場合は、検体が凍結しないようご注意ください |
| PCR産物 |
チューブに入れ、冷凍便 |
保冷剤・ドライアイスを同梱する等、検体が融解しないようご注意ください |
| RNA |
チューブに入れ、ドライアイスを同梱して冷凍便 |
|
| 調製済みライブラリ |
チューブに入れ、冷凍便 |
保冷剤・ドライアイスを同梱する等、検体が融解しないようご注意ください |
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