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サービス概要
疾患を惹起するメカニズムの解析・関連する薬物の特定
オミックスデータから薬物ターゲットとなる主要制御因子を同定するサービスです。
自動解析パイプラインであるGenome Enhancerを使用し、臨床試験で利用/試験中の薬物の中からの治療薬候補の選別、影響を与える可能性のある小分子の予測を行い、科学論文の形式に則ったレポートを返却いたします。
オミックスデータ解析の特長
- 遺伝子発現量の変動の上流にあるキーとなる因子とパスウェイを推定
- キーとなる因子に対する薬剤候補の予測
- 結果は論文形式のレポートにまとめて返却
- バイオインフォマティクスの知識は不要
Genome Enhancerの詳細はこちら →
免責事項
Genome Enhancerとは
Genome Enhancerは、ドイツgeneXplain社が提供する解析受託サービスです。Genome Enhancerは、統合型プロモーター/パスウェイ解析であるUpstream Analysisを用い、既存の研究結果に基づき潜在的な薬物ターゲットを同定します。この解析にはTRANSFAC、TRANSPATH、HumanPSDデータベースを使用しています。
- TRANSFAC：転写因子結合部位のデータベースであり、発現または変異した遺伝子を調節する転写因子の特定を行う。
- TRANSPATH：哺乳類のシグナル伝達と代謝経路のデータベースであり、TRANSFACで特定された転写因子の一般的なマスターレギュレーターを検索する。
- HumanPSD：臨床試験および医薬品のデータベースを含むヒトタンパク質のデータベースであり、膨大な文献をもとに臨床試験が実施された薬物を特定する。さらに化学情報ツールPASSを用い、特定されたターゲットに影響を与える可能性のある小分子を予測する。
| メニュー |
対象生物種 |
使用ソフトウェア |
納期 |
数量 |
価格 |
| Genome Enhancer |
ヒト*1 |
ー |
約2週間 |
1比較解析*2 |
¥ 200,000～*3 |
解析の信頼性を高めるため、最低各群2検体以上をお勧めします。
*1 マウス、ラットのデータ解析をご希望の場合、ヒトのホモログに置き換えての解析となります。まずはご相談ください。
*2 １群の検体数がいくつでも料金に影響はありません。2群間の比較であれば1比較となります。 例）疾患群10検体と対照群５検体の比較でも1比較
*3 ２解析目以降は ¥ 150,000～/比較解析となります。
納品物
・論文形式レポートのPDFファイル
ご注文について
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受け入れ可能なデータ
- 弊社受託サービス（NGS解析、マルチオミックス解析）で取得したデータ
- 他社NGS受託サービスもしくはご自身で取得されたデータ
- fastqファイルの場合：リードQC・フィルタリングおよびトリミング処理済みのデータをお送りください。これらの処理はオプションメニューでも承ります。
- カウント値(RPKM、FPKM）、あるいは発現量比較結果の場合：そのままお送りいただけます。
- Transcriptomics (RNA-seq, microarrays)
- Proteomics
備考・注意事項
- お預かりしたデータはドイツ国内のサーバにアップして解析を行います。
- 解析においてパラメーターの変更はできません。
- 納品物は論文形式レポートのPDFファイル（CD-ROM）になります。
- 受託作業は研究目的とし、診断業務については受託いたしません。
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