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サービス概要
検体中のタンパク質を高感度に同定・相対定量するサービス
サービス概要
従来のプロテオーム解析は分析深度が低く、3,000～5,000種類のタンパク質しか観測することができませんでした。これでは様々な分野で着目されることの多いキナーゼや転写因子などの微量タンパク質を観測するには不十分であり、さらなる分析深度の拡大が期待され続けてきました。
本受託サービスの解析を担うかずさDNA研究所では、分析深度、定量性に優れたDIAプロテオミクス技術を独自に最適化し、さらに最新鋭の質量分析計で測定することにより、哺乳類培養細胞から最大12,000種類のタンパク質を同定・比較定量を行えるシステムを構築しました。本サービスではこの最新鋭のシステムを用いた世界最高峰のプロテオーム解析を提供いたします。
プロテオーム受託解析の強み
- 国内で受託解析を実施しているため、海外での解析サービスと比較して安心かつ納期が早い。
- 世界最高峰のプロテオーム解析を提供します。
- 多種多様なサンプルのプロテオーム解析実績を持つ研究者が解析します。
- 専門の研究者によるコンサルティングとアフターフォロー。
使用機器
Orbitrap Exprolis 480, Orbitrap Astral (Thermo Fisher Scientific社), timsTOF HT (Bruker社）
※本サービスはタンパク質配列が解析されている生物種を対象としたものです。
免責事項
DIA解析の優れた点
分析深度
MS1で検出されたペプチドピークを選択してMS2解析を行うのではなく、MS1の全m/z レンジを細かく区切りながら連続的にMS2を取得します。これによって、ピーク強度の低いペプチドを含めてMS1で観測されたすべてのペプチドピークに対してMS2を取得できるため、微量タンパク質・ペプチドの検出が可能で分析深度の高い測定が可能です。
定量性
定量解析では実際にペプチドの同定に使われたMS2ピークを用いて定量値を算出するため、DDAプロテオーム解析のように分子量が類似するペプチドが同じ溶出時間に検出されても区別することが可能であり、ピークの取り間違えが起きづらく、正確な定量値を導き出すことができます。
取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。
DIAによる高深度発現プロテオーム解析 （凍結細胞・組織や特殊な濃縮を必要としない試料は本メニューで対応）
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
ディープDIAプロテオーム解析
Orbitrap Exploris 480 |
～9,000
タンパク質 |
タンパク質量：10ug以上
目安: 細胞 1x10^5以上,
組織 0.1mg以上 |
20 |
1～5 |
62,700 |
6検体以上は要相談 |
ウルトラディープDIAプロテオーム解析
Orbitrap Astral |
～12,000
タンパク質 |
タンパク質量：10ug以上
目安: 細胞 1x10^5以上,
組織 0.1mg以上 |
20 |
1～5 |
144,200 |
6検体以上は要相談 |
以下、MS測定の部分をディープ／ウルトラディープのパターンに分別して表示
血漿／血清 他 低侵襲検体を対象とするプロテオーム解析 （髄液や細胞外小胞などの低タンパク濃度検体は「DIAによる高深度発現プロテオーム解析」で対応）
| |
ディープ／ウルトラディープ |
|
|
|
ディープ／ウルトラディープ |
|
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
TomAP-MSによる血清／血漿プロテオーム解析
(多検体分析のニーズに対応するため、本メニューのディープのみショートグラジエントのAstralによる分析を実施） |
血漿～6,000/～8,000
血清～5,000/～7,000
タンパク質 |
血清 100 uL（それ以下でも対応可能）
血漿 50 uL（それ以下でも対応可能） |
20 |
1～5 |
72,900 / 154,400 |
6検体以上は要相談 |
| Seerによる血清／血漿プロテオーム解析 |
ー |
血清／血漿 250 uL（それ以下でも対応可能） |
ー |
ー |
要相談 |
ー |
高存在量タンパク質除去による血清／血漿プロテオーム解析
（ヒト：Top14除去、マウス、ラット：albumin/IgG除去、その他：albumin除去） |
～1,500/～3,000
タンパク質 |
血清/血漿 10uL以上 |
20 |
1～5 |
91,900 / 173,400 |
6検体以上は要相談 |
| 乾燥ろ紙血からのDIAプロテオーム解析（独自のNANDA法処理により高深度な解析が可能） |
～3,000/～7,000
タンパク質 |
DBS 直径 1.2 cm程度の
ディスク1枚分以上 |
25 |
1～5 |
84,600 / 166,100 |
6検体以上は要相談 |
| テープストリッピングサンプルからのDIAプロテオーム解析 |
準備中 |
350mm2以上の面積
直径22mmのテープを使用 |
25 |
1～5 |
84,600 / 166,100 |
6検体以上は要相談 |
DIAによるゲル中タンパク質の高感度同定解析
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
ゲル内タンパク質同定（DIA解析）
timsTOF HT |
ー |
銀染色・蛍光染色検出レベル以上 |
20 |
1～5 |
33,500 |
6検体以上は要相談 |
DIAによるアフィニティ精製試料中のタンパク同定と相対定量解析 (AP-MS)
AP：アフィニティ精製→免疫沈降、プルダウン、ビオチンアフィニティー精製など
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
AP-MS解析 （提出サンプル:ビーズ）※推奨プロトコル
ー組換えタグ付きタンパク質や特異抗体に対するターゲットタンパク質及びそのインタラクター解析ー |
ー |
2〜3 μgの抗体で免疫沈降したタンパク質 |
20 |
1～5 |
70,000 / 151,500 |
6検体以上は要相談 |
AP-MS解析 （提出サンプル:アフィニティー精製処理した溶出物）
ー組換えタグ付きタンパク質や特異抗体に対するターゲットタンパク質及びそのインタラクター解析ー |
ー |
|
20 |
1～5 |
77,300 / 158,800 |
6検体以上は要相談 |
ビオチン化タンパク質の包括的解析（提出サンプル:ビオチンラベル細胞）
ーBIo-ID, Trubo-ID細胞サンプル等の精製から対応ー |
ー |
タンパク質：100ug以上
目安: 細胞 1x10^6以上
組織片：2mg以上(組織内容要開示) |
25 |
1～5 |
99,200 / 180,700 |
6検体以上は要相談 |
ビオチン化ペプチドの包括的解析 （提出サンプル:ビオチンラベル細胞）
ーBIo-ID, Trubo-ID細胞サンプル等の精製から対応ー |
ー |
タンパク質：400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上
組織片：2mg以上(組織内容要開示) |
25 |
1～5 |
113,700 / 195,200 |
6検体以上は要相談 |
翻訳後修飾を対象としたプロテオーム解析（翻訳後修飾部位の同定と相対定量解析）
| |
ディープ／ウルトラディープ |
|
|
|
ディープ／ウルトラディープ |
|
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
| リン酸化 DIAプロテオーム解析 |
～15,000/～30,000
リン酸化ペプチド |
タンパク質：400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上,
組織 5mg以上 |
25 |
1～5 |
106,400 / 187,900 |
6検体以上は要相談 |
| リジン-アセチル化 DIAプロテオーム解析 |
準備中 |
タンパク質：400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上,
組織 5mg以上 |
25 |
1～5 |
128,300 / 209,800 |
6検体以上は要相談 |
| ユビキチン化 DIAプロテオーム解析 |
準備中 |
タンパク質：400ug以上
目安: 細胞 5x10^6以上,
組織 5mg以上 |
25 |
1～5 |
128,300 / 209,800 |
6検体以上は要相談 |
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織からのタンパク質抽出→プロテオーム解析（※）
| |
ディープ／ウルトラディープ |
|
|
|
ディープ／ウルトラディープ |
|
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
| ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織からのDIAプロテオーム解析 |
～8,000/～11,000
タンパク質 |
ホルマリン固定パラフィン包埋組織
（固定が48時間以下のもの）
厚さ:10～20 μm
表面: 50 mm2 以上 |
25 |
1～5 |
91,900 / 173,400 |
6検体以上は要相談 |
（※）FFPEサンプルからのリン酸化、リジンアセチル化、ユビキチン化プロテオームは対応可
培養上清を対象とするプロテオーム解析
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
| 無タンパク質培地を用いた培養上清からのDIAプロテオーム解析（タンパク質濃縮） |
ー |
培養上清 2mL以上 |
20 |
1～5 |
74,400 / 155,900 |
6検体以上は要相談 |
| FBS含有培養上清からのDIAプロテオーム解析（アルブミン除去） |
ー |
FBS含有培養上清 300 uL以上 |
20 |
1～5 |
91,900 / 173,400 |
6検体以上は要相談 |
追加オプション解析
| メニュー名 |
取得データ
目安 |
必要サンプル量 |
納期
(営業日) |
サンプル数 |
カタログ価格
(税別) |
備考 |
| 精製タンパク質の翻訳後修飾解析 PEAKS studio（Astaral測定のみ対応） |
ー |
ー |
+5 |
ー |
43,700 |
|
| サンプル中に含まれる動物種特定（Astaral測定のみ対応） |
ー |
ー |
+10 |
ー |
58,300 |
|
| データ解析(GO解析, Pathway解析, Upstream解析、他) |
ー |
ー |
ー |
ー |
要相談 |
|
納品物
納品形式
HDD、DVD-RまたはUSBメモリスティックに収納して納品
納品ファイル
- MS測定データ（rawファイル）
- タンパク質同定・相対定量解析データ（解析ソフトウェアDIA-NNで出力されるデータ）
- 観測されたタンパク質名（Excelファイル）
- タンパク質の定量値（Excelファイル）
ご注文について
こちらへお問い合わせください
お見積・お問い合わせは
こちらから
ご注文の流れ
- お問い合わせフォームに必要事項を記入し送信
- お打ち合わせ、お見積り兼発注書・解析依頼書の受け取り
- 販売店に発注、解析依頼書にサンプル情報を記入しEmailにて送付
- サンプル送付（印刷した解析依頼書を同梱）
サンプル送付方法
- 必要サンプル量は各メニューの記載をご参照ください。
- サンプルが必要量以下の場合、分析をお引き受けすることは可能ですが、サンプル量が少量になるに伴って観測できるタンパク質も減少します。また、1回分の分析量しか得られなかった場合にマシントラブル等で十分な測定結果が得られなかったときは無償で再測定は行いますが、サンプルの補償はできません。サンプルが必要量あるかどうか分からない場合でも、こちらでタンパク定量を行い、必要量以下のときはお客様にご連絡するようにしております。
- サンプルチューブは弊社から送付いたしますエッペンドルフ社の Safe-Lock Tube（カタログ No. 30,120,086）を推奨しております（特に微量サンプルの場合は強く推奨）。チューブはオートクレーブしていないものをご使用ください。
- ゲルサンプルの場合はケラチンなどのコンタミが確認される場合が多くあります。電気泳動、染色、切り出しなど必ず手袋をして実験者由来のコンタミが入らないように注意してください。また、ゲルの切り出しはバンド以外のゲルが極力入らないように切り出してください。ゲル体積が増えると非特異的吸着も増え、損失を招くことになります。
- サンプル送付前にサンプル情報を記載した解析依頼書（Excelファイル）をメールにてお送りください。サンプル送付時にはプリントアウトした解析依頼書を同梱してください。
| サンプル |
ご提供サンプル |
送付方法 |
| 培養細胞 |
培地を除去後、PBSにて2回洗浄し、チューブに入れて液体窒素で凍結＊ |
ドライアイスを同梱し冷凍便 |
| 組織 |
取り出した組織をPBSにて血液を除去し、チューブに入れて液体窒素で凍結＊ |
ドライアイスを同梱し冷凍便 |
| タンパク質抽出物 |
チューブに入れて液体窒素で凍結＊ |
ドライアイスを同梱し冷凍便 |
| 血漿・血清 |
チューブに入れて液体窒素で凍結＊ |
ドライアイスを同梱し冷凍便 |
| 培養上清 |
500×g、5分程度の弱い遠心で細胞を除去し、さらに15,000×g 10分程度の遠心で細胞片などを除去した上清をチューブに入れて液体窒素で凍結＊ |
ドライアイスを同梱し冷凍便 |
| ゲル片（CBB染色、質量分析用銀染色、他） |
切り出したゲルをチューブに入れてパラフィルムを巻く |
保冷剤を同梱し冷蔵便 |
| ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 |
弊社から送付いたしますエッペンドルフ社のセーフロックチューブに入れてパラフィルムを巻く（ホルマリン固定時間が48時間以下のサンプルのみ受託を引き受けることが可） |
常温便 |
| アフィニティ精製試料（ビーズ） |
弊社から送付いたしますバッファー 100uLを添加し、チューブが転倒しないようラック等に入れる。 |
保冷剤を同梱し冷蔵便 |
- ＊長期保存の場合はスクリュータイプのしっかりと密閉できるチューブを推奨します。
- ＊液体窒素がない場合は速やかに-80℃で凍結してください（金属ブロックなどがあれば、事前に-80℃に入れ、そこにサンプルを置いて急速に凍結させることを推奨）
- その他のサンプル詳細につきましてはお問い合わせください。
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