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サービス概要
単離した個々の細胞である一細胞（シングルセル）毎に、遺伝子発現や表面抗原などを解析し、細胞の多様性や不均一性をみるサービス
サービス概要
一細胞（シングルセル）解析では、10xGenomics社のChromium Xを使用して、一細胞を個々のドロップレットに単離し、遺伝子の発現量、表面タンパク質、オープンクロマチン領域等を解析します。
本受託サービスでは、ユーザー様のラボにChromium Xを持ち込み、新鮮な細胞のドロップレットへの単離からcDNA合成までを行います。得られたcDNAは弊社に持ち帰り、ライブラリー調製、シーケンス解析、およびデータ解析（Cell Ranger解析）までを実施し、結果データを納品いたします。本受託サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。
一細胞受託解析の強み
- 国内で受託解析を実施しているため、海外での解析サービスと比較して安心。
- 専門の研究者によるコンサルティングとアフターフォロー。
使用機器
- Chromium X（10xGenomics社）
- NextSeq500（illumina社）、DNBSEQ-G400RS（MGI社）、Sequel Iie（PacBio社）
免責事項
サンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。
取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。
一細胞解析
| 解析メニュー |
取得データ目安 |
必要サンプル量 |
納 期 |
| 一細胞RNA-Seq用 |
解析する細胞数、細胞あたりのリード数に応じて変更いたします。 |
解析する細胞数の1.6倍量をご用意ください。 |
- |
| 一細胞V(D)J用 |
| 一細胞Multiome用 |
| 一細胞 Fixed RNA用 |
| シーケンサーラン |
| NextSeq |
解析する細胞数、細胞あたりのリード数に応じて変更いたします。 |
- |
8～12週間 |
| DNBSEQ-G400RS |
| PacBio Sequel IIe |
- ※一細胞の濃度と生存率を測定した一細胞のサンプル懸濁液は、ユーザー様がご用意下さい。
- ※モデル生物以外の解析については、事前にお問い合わせの上ご確認下さい。
納品物
HDDまたはDVD-Rに収納して納品
- Fastqファイル
- 作業報告書
- Cell Ranger Report
- Loupe Browser ファイル
ご注文について
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お見積・お問い合わせは
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ご注文の流れ
- お問い合わせメールに必要事項を記入し送信
- お打ち合わせ、お見積兼発注書・解析依頼書の受け取り、出張作業日の日程調整、ご予約
- ユーザー様のラボでの出張作業、cDNAサンプルのお引き取り
- ご依頼いただく解析メニューによっては、試薬のお取り寄せに1ヶ月程度お時間をいただくことがあります。
- 出張作業をご予約いただいた後のキャンセルは原則としてお受けできません。
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