次世代シーケンス GRAS-Di®技術によるゲノム解析

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GRAS-Di 解析結果の見方

・優性マーカーのジェノタイピング結果 ※動画「はじめてのGRAS-Di」もご参考ください

トヨタ自動車社ソフトウェアを用いた解析では、このような結果が得られます。
父サンプルと母サンプルの掛け合わせで、2サンプルの子供（子1と子2）が得られた例です。

例えば、1つ目の遺伝子座に注目すると、
父ではアンプリコンが増えていますが、母ではアンプリコンが増えていません。
子1ではアンプリコンが増えているため、父と同じジェノタイプを持ち、
子2ではアンプリコンが増えていないため、母と同じジェノタイプを持つことになります。

解析結果の表では、アンプリコンが増えている場合は「P」、
アンプリコンが増えていない場合は「N」と表されます。

・共優性マーカーの検出結果

優性マーカー同士で配列パターンでグルーピングをして、分離比でフィルタリングを行うことで、共有性マーカーのペアを検出することができます。

例えば、アンプリコン1とアンプリコン5は配列はほとんど同じですが、「A」という塩基をもつアンプリコン1は6本、「C」という塩基をもつアンプリコンは2本あり、分離比として「3:1」となります。

・マッピング結果