次世代シーケンスゲノム解析

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NavaSeq相乗りサービス！

1レーンあたり120Gbの高出力により、シーケンスコストが格段にお安くなりました！
1サンプル 25,680円(参考価格)（1Gb/sample~)より　※10サンプル以上ご依頼の場合
6～10週間で納品

特徴

ゲノム解析
【ゲノム解析　HiSeqXバリュープライス】

ゲノム情報が利用可能な生物種の変異・バリアントの探索を目的とした、ゲノムリシーケンシング解析を行います。ゲノム情報が利用できない生物種でも、バイオインフォマティクス解析なしのゲノムシーケンスまでは行います。

標準ゲノムショットガン：インサートサイズ350bp
カスタムゲノムショットガン：インサートサイズ550bp
バイオインフォマティクス解析：参照ゲノム配列へのマッピング、変異候補探索、変異候補部位のアノテーション付与

サンプル条件

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

標準ゲノムショットガン：高品質のゲノムDNAを2μg以上（濃度は20ng/μl以上）ご調製ください。
カスタムゲノムショットガン：高品質のゲノムDNAを5μg以上（濃度は20ng/μl以上）ご調製ください。
核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
※品質が良くない場合は、特別な処理が必要になり、追加料金を頂戴することもございます。
RNAのコンタミネーションがないことを確認してください（RNase処理を推奨）。
冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。

サービス内容

受領したDNAサンプルについて、品質確認（サンプルQC）を行います。
ご指定のサイズにDNAを断片化後、サイズセレクションを行います（*1）
断片化したDNAにアダプターを付加し、ゲノムショットガンライブラリーを調製します。
調製したライブラリーをシーケンシングします。
（オプション解析）参照ゲノムにマッピングした後、変異箇所の抽出などの解析が可能です。

*1：DNAの断片化及びサイズセレクション

・ゲノムショットガンライブラリ調製： 350 bpインサート

ゲノムDNAをサンプルとしてお預かりして調製する、標準のゲノムショットガンライブラリとなります。物理的切断によりゲノムDNAを約 350bp の大きさに切断し、所定のアダプタを付加することにより、ゲノムショットガンライブラリを調製します。HiSeq X 2x150bp 解析では、インサート長平均 350bp のゲノムインサートの両端 150bp をシーケンシングします。

・ゲノムショットガンライブラリ調製： 550 bpインサート

標準では 350bp のインサートサイズのゲノムショットガンライブラリですが、550bp のインサートサイズのカスタムサイズのゲノムショットガンライブラリを調製することも可能です。標準350bpよりも長いインサートサイズのライブラリをシーケンシング解析することで、de novo アセンブルの精度向上の可能性が高まります。HiSeq X 2x150bp 解析では、インサート長平均 550bp のゲノムインサートの両端 150bp をシーケンシングします。

ゲノムショットガンライブラリ調整

納品物

DNA-Seq データのマッピング＆変異解析

シーケンシング配列データ（Rawデータ）：FASTQ形式

解析ありの場合
シーケンシング配列データ（クリーニング後）：FASTQ形式
マッピング結果データ： bam形式
変異解析結果データ： vcf形式（例示の図表をご覧ください）

価格・納期

ゲノム解析

サンプルQC、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
HiSeq X 2x150bp、10Gb/total～、20Gb/total～、40Gb/total～、80Gb/total～、1レーン
納期：サンプルQC合格後6～10週

【相乗り参考価格（例）】

＜10Gb/total～の場合＞

項目	合計	1サンプルあたり
項目	合計	参考価格	データ量
1サンプルバリュープライス	￥62,400	￥62,400	10Gb/sample～
1サンプルバリュープライス	＜変異候補抽出解析　＋￥48,000/sample＞
2サンプルバリュープライス	￥127,200	￥31,800	平均5Gb/sample～
2サンプルバリュープライス	＜変異候補抽出解析　＋￥36,000/sample＞
4サンプルバリュープライス	￥256,800	￥25,680	平均2.5Gb/sample～
4サンプルバリュープライス	＜変異候補抽出解析　＋￥36,000/sample＞