NGS / de novo ゲノム解析 (PacBio Sequel)

Service > NGS > denovo_genome_pacbiosequel

▼ 特徴　 ▼ サンプル条件　 ▼ サービス内容　 ▼ 納品物　 ▼ 価格・納期　 ▼ お見積もり・資料請求

特徴

PacBio Sequelは、従来のPacBio RSIIの平均約7倍以上の高出力なシーケンシングです。
RSIIの従来の特徴（前処理のPCR増幅を行わない1分子によるリアルタイム(SMRT)解析や、20kbサイズを目安に可能な限り大きなライブラリサイズの調製）はそのままに、ゲノムサイズが大きな微生物でもde novoゲノム解析が行いやすくなりました。

データ量：1SMRT Cellあたり3-5Gb
最大リード長：40kb以上
ライブラリサイズ：20kb

高出力のSequelによるシーケンシング
ゲノムサイズが大きな微生物でも利用しやすく！
従来のRSIIで10セルが必要だった微生物では、Sequelを使うと3セルでシーケンス可能に！
1分子によるリアルタイム解析
前処理のPCRを伴わない1分子によるリアルタイム(SMRT)解析
20kbサイズを目安に可能な限り大きなライブラリサイズ
de novo ゲノム解析に最適

PacBio Sequel

サンプル条件

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

高品質のゲノムDNAを20μg以上（濃度は100-300ng/μl）ご調製ください。
核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
DNAサンプルはEDTAを含まないバッファーに溶解してください。
電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
RNAのコンタミネーションがないことを確認してください（RNase処理を推奨）。
冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。

サービス内容

受領したDNAサンプルについて、品質確認（サンプルQC）を行います。
DNAを断片化後、BluePippinによるサイズセレクションを行います。
磁気ビーズによるDNA精製後、20kbを目安に可能な限り大きいインサートサイズのSMRT Bellライブラリ調製を行います。
調製したライブラリーをPacBio Sequel P6C4系 SMRT cellによりシーケンシングします。

※PacBio Sequel 次世代シーケンシングサービスは、リード数、リード長、総解析塩基数、データ品質、納期について、当社にて一切の保証をすることができません。

納品物

PacBio Sequelシーケンサの出力データ（BAM形式）
シーケンス結果のサマリーレポートファイル（PDF形式）

価格・納期

de novoゲノム解析（PacBio Sequel）

サンプルQC、SMRT Bellライブラリ調製、出荷費用を含みます
PacBio Sequel v2 chemistry
20kbを目安として可能な限り大きいSMRT Bellライブラリ調製
最大40kb/read, 1 SMRT Cell, 3-5Gb/total
バイオインフォマティックス解析：なし ※