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NGS / de novo ゲノム解析 (PacBio)

Service > NGS > denovo_genome_pacbio
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サンプル条件  サービス内容  納品物  価格・納期  お見積もり・資料請求

 

サンプル条件

 

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

 

  • 高品質のゲノムDNAを20μg以上(濃度は100-300ng/μl)ご調製ください。
  • 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
  • DNAサンプルはEDTAを含まないバッファーに溶解してください。
  • 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
  • RNAのコンタミネーションがないことを確認してください(RNase処理を推奨)。
  • 冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。

 

サービス内容

 

  1. 受領したDNAサンプルについて、品質確認(サンプルQC)を行います。
  2. DNAを断片化後、BluePippinによるサイズセレクションを行います。
  3. 磁気ビーズによるDNA精製後、20kbを目安に可能な限り大きいインサートサイズのSMRT Bellライブラリ調製を行います。
  4. 調製したライブラリーをPacBio SMRT cellによりシーケンシングします。

 

※PacBio 次世代シーケンシングサービスは、リード数、リード長、総解析塩基数、データ品質、納期について、当社にて一切の保証をすることができません。

 

納品物

 

  • PacBioの出力データ(BAM形式)
  • シーケンス結果のサマリーレポートファイル(PDF形式)

 

価格・納期

 

de novoゲノム解析(PacBio)

 

  • サンプルQC、SMRT Bellライブラリ調製、出荷費用を含みます
  • バイオインフォマティックス解析:なし ※

 

  • 参考価格 :ご相談
  • 納期 :10~12週

 

※バイオインフォマティクス解析(De novoアセンブル解析)の価格は生物種やゲノムサイズなどの条件によって異なってきますので、ご相談ください。

 

その他、詳細は「お見積もり・資料請求」よりお問合せ下さい。

 


お問い合わせ

サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。

ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-6631-0106

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HiSeq, MiSeqはIllumina社の、PacBiolはPacific Bioscience社の商標です。

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