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次世代シーケンス ゲノム解析

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価格・納期  特徴  サンプル条件  サービス内容  納品物  お見積もり・資料請求

 

Information

  • 納期短縮プランにパワーアップ!サンプルQC合格から納品まで最短1か月!pdf(PDF)

 

NovaSeq相乗りサービス!

  • 1レーンあたり120Gbの高出力により、シーケンスコストが格段にお安くなりました!
  • 1サンプル 25,680円(参考価格)(1Gb/sample~)より ※10サンプル以上ご依頼の場合
  • 4~7週間で納品

 

価格・納期

 

ゲノム解析

 

  • サンプルQC、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
  • NovaSeq X 2x150bp、10Gb/total~、20Gb/total~、40Gb/total~、80Gb/total~、1レーン
  • 納期:サンプルQC合格後4~7週
    ※ バイオインフォマティクス解析ありの場合、+1~2週

 

【相乗り参考価格(例)】

 

<10Gb/total~の場合>

項目 合計 1サンプルあたり
参考価格 データ量
1サンプル バリュープライス ¥62,400 ¥62,400 10Gb/sample~
<変異候補抽出解析 +¥48,000/sample>
2サンプル バリュープライス ¥84,000 ¥42,000 平均5Gb/sample~
<変異候補抽出解析 +¥48,000/sample>
10サンプル バリュープライス ¥256,800 ¥25,680 平均1Gb/sample~
<変異候補抽出解析 +¥36,000/sample>

 

10Gb/total 以外のデータ量も承っておりますので、下記のお見積りフォームよりお問い合わせください。

 

特徴

 

ゲノム解析
【ゲノム解析 NovaSeqバリュープライス】

 

ゲノム情報が利用可能な生物種の変異・バリアントの探索を目的とした、ゲノムリシーケンシング解析を行います。 ゲノム情報が利用できない生物種でも、バイオインフォマティクス解析なしのゲノムシーケンスまでは行います。

  • 標準全ゲノム解析: インサートサイズ350bp
  • バイオインフォマティクス解析:参照ゲノム配列へのマッピング、変異候補探索、変異候補部位のアノテ ーション付与

 

サンプル条件

 

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

 

  • 標準全ゲノム解析:高品質のゲノムDNAを2μg以上(濃度は20ng/μl以上)ご調製ください。
  • カスタムゲノムショットガン:高品質のゲノムDNAを5μg以上(濃度は20ng/μl以上)ご調製ください。
  • 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
  • DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
  • 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
    ※品質が良くない場合は、特別な処理が必要になり、追加料金を頂戴することもございます。
  • RNAのコンタミネーションがないことを確認してください(RNase処理を推奨)。
  • 冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。

 

サービス内容

 

  1. 受領したDNAサンプルについて、品質確認(サンプルQC)を行います。
  2. DNAを断片化後、サイズセレクションを行います(*1)
  3. 断片化したDNAにアダプターを付加し、ゲノムショットガンライブラリーを調製します。
  4. 調製したライブラリーをシーケンシングします。
  5. (オプション解析)参照ゲノムにマッピングした後、変異箇所の抽出などの解析が可能です。

 

*1:DNAの断片化及びサイズセレクション

・ゲノム ショットガン ライブラリ調製: 350 bpインサート

 

ゲノムDNAをサンプルとしてお預かりして調製する、標準のゲノムショットガンライブラリとなります。物理的切断によりゲノムDNAを約 350bp の大きさに切断し、所定のアダプタを付加することにより、ゲノムショットガンライブラリを調製します。NovaSeq X 2x150bp 解析では、インサート長平均 350bp のゲノムインサートの両端 150bp をシーケンシングします。

 

ゲノムショットガンライブラリ調整

 

納品物

 

DNA-Seq データのマッピング&変異解析

 

    解析なしの場合
  • シーケンシング配列データ(Rawデータ):FASTQ形式

    解析ありの場合
  • シーケンシング配列データ(クリーニング後):FASTQ形式
  • マッピング結果データ: bam形式
  • 変異解析結果データ: vcf形式(例示の図表をご覧ください)

 

DNA-Seq データのマッピング&変異解析

 

  お見積りはコチラ  

 

 


お問い合わせ

サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。

ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-6631-0106

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NovaSeq, MiSeqはIllumina社の、PacBio SequelはPacific Bioscience社の商標です。

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