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• よくあるご質問(FAQ)

• 【内容】ライブラリ調製からシーケンス、データ解析まで
  　　GRAS-Di^®ライブラリ調製
  　　NovaSeqによるシーケンス
  　　期待リード数：平均 5 Mread/sample
  　　GRAS-Di^®解析ソフトによるシーケンスデータの解析（アンプリコンの有無をベース
  　　にしたジェノタイピング結果、アンプリコンマーカーのマッピング結果）
  
  
• 【オプション】
  　　ゲノム情報が利用可能な生物種では、バイオインフォマティクスのご相談を承ります。
  　　（SNP抽出）
  　　※解析可能な生物種についてはお問合せください。
  
  
• 【納品物】
  　　シーケンシング配列データ（fastq形式）
  　　GRAS-Di^®解析ソフトによる解析結果（Excelで閲覧可能な形式）
  　　※GRAS-Di紹介動画も併せてご参照ください
  　　共優性マーカーの詳細情報 ^※
  　　アンプリコンのマッピング位置情報 ^※
  　　※解析のご対応可能な場合に納品させて頂きます。

• ●TEへ溶出したgDNA ( >30ng/ul, >20ul)をご準備いただきお送りください。
  ●濃度はUVを用いた吸光光度法により測定・ご確認ください。
  （蛍光測定法による定量はご遠慮ください）
  ●冷蔵便もしくは冷凍便にてサンプルDNAはご送付ください。
  　　※ サンプルが規定量に達しない場合はご相談ください。
  　　※ 電気泳動法などを利用し、RNAのコンタミネーションがないこと、gDNAが分解
  　　していないことをご確認ください。
  
  

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  サンプル発送時の注意事項
  指定のチューブあるいはプレートでお送り下さい。ご用意が難しい場合は発送前にご連絡下さい。
  48サンプル以上の場合は、取り扱い時のミスを避ける為にプレートでお送りください。
  プレートの場合、8連キャップにて密閉し、液漏れがないことを確認の上、ご発送ください。
  追加作業の必要性が生じた場合は、納期の変更、あるいは追加料金が発生することもあること、予めご了承下さい。

イルミナ株式会社ウェビナー
「次世代シーケンサーを利用した新規genotyping技術GRAS-Di^®の開発」

優性マーカー/共有性マーカーのジェノタイピング結果 & 染色体マッピングについて

分離集団の解析、自然集団の解析について

よくあるご質問

GRAS-Di^®をご利用いただいた論文

参考文献ページから各論文へ移行できます

(1)弊社サービスをご利用いただいた論文

• Genomic evidence for speciation with gene flow in broadcast spawning marine invertebrates.
  Hirase S, Yamasaki YY, Sekino M, Nishisako M, Ikeda M, Hara M, Merilä J, Kikuchi K. (2021)
  Mol Biol Evol. doi: 10.1093/molbev/msab194.
• Effect of Three Types of Ion Beam Irradiation on Gerbera (Gerbera hybrida) In Vitro Shoots with Mutagenesis Efficiency.
  Hosoguchi T, Uchiyama Y, Komazawa H, Yahata M, Shimokawa T, Tominaga A. (2021)
  Plants. 10:1480.
• Major and Stable Quantitative Trait Locus qSS2 for Seed Size and Shape Traits in a Soybean RIL Population.
  Kumawat G, Xu D. A. (2021)
  Front Genet. 12:646102.
• QTL analysis of crown gall disease resistance in apple: first plant R gene candidates effective against Rhizobium rhizogenes (Ti).
  Moriya, S., Iwanami, H., Haji, T. et al. (2021)
  Tree Genetics & Genomes 17:25.
• Genetic Dissection of a Precocious Phenotype in Male Tiger Pufferfish (Takifugu rubripes) using Genotyping by Random Amplicon Sequencing, Direct (GRAS-Di).
  Yoshikawa S, Hamasaki M, Kadomura K, Yamada T, Chuda H, Kikuchi K, Hosoya S. (2021)
  Mar Biotechnol (NY). doi: 10.1007/s10126-020-10013-4.
• Random PCR-based genotyping by sequencing technology GRAS-Di (genotyping by random amplicon sequencing, direct) reveals genetic structure of mangrove fishes.
  Hosoya S, Hirase S, Kikuchi K, Nanjo K, Nakamura Y, Kohno H, Sano M.
  Mol Ecol Resour. 2019 Sep; 19:1153-1163. doi: 10.1111/1755-0998.13025.

(2)GRAS-Di技術ご利用論文（弊社以外でのサービスご利用者様を含む）

対応生物種 豊富な解析実績　国内外から120生物種以上、70,000サンプル以上 (2022年9月時点)

トヨタ自動車株式会社様 検証済み対応生物種（58生物種）

イネ コムギ トウモロコシ サトウキビ ダイズ ラッカセイ エンドウ トマト ナス ピーマン パプリカ ジャガイモ サツマイモ キャベツ レタス ハクサイ

ダイコン ブロッコリー カリフラワー ネギ タマネギ キュウリ カボチャ ホウレンソウ ニンジン ゴボウ イチゴ メロン スイカ サブクローバー ホースグラム

ミヤコグサ リンゴ モモ ナシ オレンジ カキ ブドウ イチジク キウイ ユズ スダチ プルーン キク スギ サクラ

ヒト ウシ ブタ ニワトリ ウマ ウサギ ハムスター モルモット ラット マグロ シイタケ マイタケ

 

ユーロフィンジェノミクス株式会社 受託実績 （数万検体以上）※

植物　（イネ、かんきつ類、バラ類、アブラナ科、セリ科） 動物　（魚類、貝類、昆虫類）

※一度に1,000検体以上のご依頼も承ります。

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• 医薬品分析・創薬支援
• 衛生検査・臨床試験
• 食品分析・アグロケミカル
• 材料分析・製品分析
• 環境分析・管理部門

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